Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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