Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms