Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF1Q13351 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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