Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME3Q13232 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME3Q13232 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME3Q13232 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME3Q13232 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NME3Q13232 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME3Q13232 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME3Q13232 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME3Q13232 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME3Q13232 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME3Q13232 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME3Q13232 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME3Q13232 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME3Q13232 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME3Q13232 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NME3Q13232 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NME3Q13232 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NME3Q13232 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NME3Q13232 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NME3Q13232 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME3Q13232 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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