Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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RESTQ13127 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RESTQ13127 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RESTQ13127 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RESTQ13127 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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RESTQ13127 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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RESTQ13127 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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RESTQ13127 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RESTQ13127 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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RESTQ13127 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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RESTQ13127 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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RESTQ13127 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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RESTQ13127 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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RESTQ13127 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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RESTQ13127 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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RESTQ13127 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RESTQ13127 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RESTQ13127 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RESTQ13127 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RESTQ13127 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RESTQ13127 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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RESTQ13127 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RESTQ13127 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RESTQ13127 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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RESTQ13127 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RESTQ13127 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RESTQ13127 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RESTQ13127 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RESTQ13127 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RESTQ13127 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RESTQ13127 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RESTQ13127 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RESTQ13127 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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