Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECH1Q13011 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECH1Q13011 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECH1Q13011 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECH1Q13011 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECH1Q13011 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECH1Q13011 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECH1Q13011 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECH1Q13011 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECH1Q13011 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECH1Q13011 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECH1Q13011 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ECH1Q13011 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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