Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms