Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms