Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms