Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms