Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX1P83916 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX1P83916 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX1P83916 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX1P83916 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX1P83916 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX1P83916 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX1P83916 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX1P83916 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX1P83916 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX1P83916 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX1P83916 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX1P83916 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX1P83916 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX1P83916 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX1P83916 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX1P83916 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX1P83916 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX1P83916 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX1P83916 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX1P83916 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms