Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IRX1P78414 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IRX1P78414 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IRX1P78414 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRX1P78414 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRX1P78414 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IRX1P78414 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRX1P78414 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRX1P78414 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRX1P78414 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRX1P78414 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRX1P78414 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRX1P78414 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRX1P78414 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRX1P78414 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRX1P78414 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRX1P78414 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms