Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2P78314 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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