Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM193AP78312 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms