Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms