Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPK4P57078 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms