Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TPTEP56180 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TPTEP56180 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TPTEP56180 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TPTEP56180 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TPTEP56180 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TPTEP56180 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TPTEP56180 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TPTEP56180 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TPTEP56180 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TPTEP56180 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TPTEP56180 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TPTEP56180 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TPTEP56180 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TPTEP56180 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms