Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms