Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKAA2P54646 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms