Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms