Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms