Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms