Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTDSS1P48651 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms