Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5OP48047 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5OP48047 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5OP48047 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5OP48047 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5OP48047 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5OP48047 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5OP48047 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5OP48047 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5OP48047 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5OP48047 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5OP48047 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5OP48047 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5OP48047 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5OP48047 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5OP48047 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5OP48047 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5OP48047 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5OP48047 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5OP48047 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5OP48047 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5OP48047 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5OP48047 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms