Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms