Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGDSP41222 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms