Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTX2P32243 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTX2P32243 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTX2P32243 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms