Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA11P31270 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA11P31270 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA11P31270 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA11P31270 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA11P31270 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA11P31270 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA11P31270 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA11P31270 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA11P31270 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA11P31270 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA11P31270 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA11P31270 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA11P31270 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA11P31270 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA11P31270 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA11P31270 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA11P31270 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA11P31270 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA11P31270 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA11P31270 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA11P31270 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA11P31270 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms