Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMBRP28336 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMBRP28336 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMBRP28336 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMBRP28336 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMBRP28336 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMBRP28336 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMBRP28336 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMBRP28336 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMBRP28336 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMBRP28336 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NMBRP28336 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMBRP28336 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMBRP28336 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMBRP28336 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMBRP28336 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMBRP28336 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NMBRP28336 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NMBRP28336 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NMBRP28336 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NMBRP28336 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NMBRP28336 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NMBRP28336 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NMBRP28336 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NMBRP28336 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMBRP28336 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NMBRP28336 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMBRP28336 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMBRP28336 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NMBRP28336 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMBRP28336 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMBRP28336 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMBRP28336 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMBRP28336 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMBRP28336 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMBRP28336 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMBRP28336 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMBRP28336 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMBRP28336 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMBRP28336 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMBRP28336 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMBRP28336 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMBRP28336 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMBRP28336 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NMBRP28336 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMBRP28336 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms