Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCD3P28288 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ABCD3P28288 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ABCD3P28288 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ABCD3P28288 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ABCD3P28288 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ABCD3P28288 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ABCD3P28288 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCD3P28288 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCD3P28288 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCD3P28288 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCD3P28288 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCD3P28288 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCD3P28288 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCD3P28288 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCD3P28288 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCD3P28288 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCD3P28288 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCD3P28288 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCD3P28288 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCD3P28288 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCD3P28288 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms