Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms