Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD53P19397 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD53P19397 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD53P19397 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD53P19397 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD53P19397 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD53P19397 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD53P19397 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD53P19397 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD53P19397 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD53P19397 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD53P19397 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD53P19397 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD53P19397 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD53P19397 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD53P19397 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms