Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FDPSP14324 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FDPSP14324 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FDPSP14324 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FDPSP14324 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FDPSP14324 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FDPSP14324 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FDPSP14324 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FDPSP14324 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FDPSP14324 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FDPSP14324 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FDPSP14324 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FDPSP14324 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FDPSP14324 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FDPSP14324 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FDPSP14324 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FDPSP14324 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FDPSP14324 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FDPSP14324 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FDPSP14324 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FDPSP14324 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FDPSP14324 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FDPSP14324 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FDPSP14324 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FDPSP14324 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FDPSP14324 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FDPSP14324 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FDPSP14324 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FDPSP14324 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FDPSP14324 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FDPSP14324 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FDPSP14324 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FDPSP14324 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FDPSP14324 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FDPSP14324 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FDPSP14324 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FDPSP14324 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FDPSP14324 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FDPSP14324 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FDPSP14324 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FDPSP14324 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FDPSP14324 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms