Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
LAMC1P11047 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms