Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB1P04280 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB1P04280 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB1P04280 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB1P04280 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB1P04280 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB1P04280 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB1P04280 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB1P04280 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB1P04280 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB1P04280 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB1P04280 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB1P04280 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB1P04280 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB1P04280 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRB1P04280 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRB1P04280 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRB1P04280 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRB1P04280 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms