Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGHG1P01857 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms