Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFDP00746 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFDP00746 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFDP00746 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms