Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPAN13O95857 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms