Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL41O60662 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL41O60662 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL41O60662 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL41O60662 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL41O60662 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL41O60662 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL41O60662 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL41O60662 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL41O60662 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL41O60662 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL41O60662 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL41O60662 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL41O60662 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL41O60662 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL41O60662 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL41O60662 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL41O60662 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL41O60662 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL41O60662 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms