Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLOCKO15516 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLOCKO15516 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms