Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIEO00221 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms