Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms