Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KR12 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KR12 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KR12 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KR12 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms