Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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