Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms