Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PIPSLA2A3N6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIPSLA2A3N6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms