Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP16Q9Y5T5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms