Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM35Q9UPQ4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms