Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS4AQ9UN37 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS4AQ9UN37 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS4AQ9UN37 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS4AQ9UN37 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
VPS4AQ9UN37 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
VPS4AQ9UN37 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 450.6 ms