Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMFRQ9UKV5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms